基因组图谱阐述早期EGFR肺癌存在异质性,精确聚合调整计谋有望破局。
韩国粹者通过新一代测序本事系统神气早期与晚期EGFR突变(NSCLC)的基因组特征,揭示早期患者中巨额存在的共存基因变异与较低的EGFR突变丰采,为早期EGFR酪氨酸激酶扼制剂(EGFR-TKI)先天耐药机制提供迫切分子依据。
跟着第三代EGFR-TKI在早期NSCLC提拔调整中的等闲应用,怎样准确识别可能从单纯EGFR-TKI调整中获益的患者,以及哪些患者需要聚合调整计谋,已成为临床推行的要害问题。尽管ADAURA参谋阐述提拔奥希替尼可显赫改善术后无病生活,仍有约16%的患者在三年内出现复发或耗损[1],辅导先天耐药机制的存在。发表于Cancer Research and Treatment的一项参谋[2],通过系统比较早期与晚期EGFR突变NSCLC的基因组图谱,揭示了早期疾病中已存在的基因组异质性特征,为交融先天耐药机制提供了新的视角。
参谋布景与临床问题
肺癌当作大众联系耗损的主要原因,其调整计谋正逐步向精确化标的发展。EGFR突变当作NSCLC中最常见的入手基因变异之一,在亚洲东谈主群和非抽烟患者中尤为常见。尽管奥希替尼提拔调整显赫改善了早期EGFR突变NSCLC患者的预后,但临床推行中仍面对迫切挑战,并非扫数患者都能从单一EGFR-TKI调整中握续获益。
共存基因变异如TP53突变或MET扩增可能与EGFR-TKI的先天耐药联系,在晚期疾病中,这些共存变异已被阐述可影响调整反应和生活扣局。然而,在早期EGFR突变NSCLC中,基因组特征偏执对调整反应的影响尚未皆备文牍。特别是对于早期与晚期疾病基因组各异的径直比较参谋极为有限。为此,参谋团队诓骗靶向新一代测序本事,对早期和晚期EGFR突变NSCLC的基因组谱进行了系统分析,旨在揭示可能导致早期疾病中对EGFR-TKI先天耐药的分子机制。
参谋考虑与智力
这项总结性不雅察性参谋分析了来自釜山国立大学病院肺癌NGS登记处的160例EGFR突变NSCLC患者,其中包括100例早期患者和60例晚期患者。扫数患者均汲取基于组织的靶向NGS检测,隐私501个癌症联系基因。参谋团队系统分析了共存基因变异、肿瘤突变负荷以及EGFR突变的变异等位基因频率等要害基因组主见。
为确保数据质地,参谋设定了严格的肿瘤纯度阈值,仅纳入肿瘤细胞含量卓绝30%的样本。检测历程采用Ion Torrent S5 XL平台,平均测序深度达1200×,最低检测限为5% VAF。信号通路篡改分析基于癌症基因组图谱界说的10条中枢致癌通路,包括细胞周期、Hippo、Myc、Notch、NRF2、PI3K/Akt、RTK-RAS/MAPK、TGFβ、p53和Wnt通路。
参谋成果:早期与晚期疾病的基因组各异
参谋发现,早期和晚期EGFR突变NSCLC患者在共存基因变异的发生率上无显赫各异,早期组为82.0%,晚期组为91.7%。然而,早期患者的共存变异数目显赫少于晚期患者,中位数分辨为2和3。更为迫切的是,早期患者中高度信号通路篡改的比例显赫低于晚期患者,分辨为17.0%和40.0%。具体而言,细胞周期、PI3K、Myc和Wnt通路在早期疾病中的篡改频率显赫较低。
肿瘤突变负荷分析表现,早期和晚期患者的中位TMB均为3.8突变/Mb,无显赫各异。然而,EGFR突变的VAF在早期患者中显赫低于晚期患者,中位值分辨为19.3%和29.6%。这一各异在常见EGFR突变亚组中尤为显豁。值得凝视的是,跟着疾病阐述,TMB保握表现,而EGFR突变的VAF显赫加多,辅导在肿瘤演进过程中EGFR突变克隆的扩增。
在特定基因变异方面,TP53和RBM10的单核苷酸变异频率在早期和晚期疾病间无显赫各异。然而,EGFR、RAC1、FOXA1和MET的扩增在早期患者中较稀有。插入缺失变异的发生率在两组间相似。
临床深嗜与调整启示
本参谋揭示了EGFR突变NSCLC在早期疾病阶段已存在显赫的基因组异质性,这可能是导致部分早期患者对EGFR-TKI产生先天耐药的基础。尽管提拔奥希替尼显赫改善了早期EGFR突变NSCLC的预后,但仍有很是比例患者资历复发,辅导单纯EGFR-TKI调整可能不及以摒除扫数佩戴共存基因变异的克隆。
参谋成果撑握在早期EGFR突变NSCLC中洽商聚合调整计谋的合感性。特别是对于佩戴多通路篡改或特定共存变异的患者,EGFR-TKI单药调整可能无法皆备扼制肿瘤滋长。近期公布的FLAURA2已阐述,在晚期疾病中,奥希替尼聚合化疗比较单药调整可带来更大获益。本参谋提供的基因组凭证标明,肖似的聚认为谋可能在遴选的早期患者中不异有用。
EGFR突变VAF在早期疾病中的显赫镌汰尤其值得戒备。参谋标明,较高的EGFR突变丰采与更好的TKI调整反应联系。早期疾病中较低的EGFR VAF可能响应了肿瘤内更高的异质性和更复杂的克隆结构。
参谋局限性与往常标的
本参谋当作单中心总结性分析,存在一定的局限性。样蓝本源的各异可能影响VAF测量的准确性,尽管参谋已通过严格的肿瘤纯度阈值进行质地适度。PCR扩增为基础的靶向富集智力在隐私均一性和变异检测方面可能存在局限。此外,相对较短的随访时候终澄莹对基于基因组特征的生活成果进行深化分析的智力。
往常参谋应致力于在前瞻性队伍中考证这些发现,并探索特定共存变异对调整反应的预测价值。同期,需要更深化交融不同信号通路篡改之间的相互作用,以及它们怎样共同影响EGFR-TKI的疗效。跟着检测本事的跳跃,将基因组信息与转录组和卵白组数据整合,可能提供更全面的生物学视力,最终联结早期EGFR突变NSCLC的个体化调整决议。
论断与临床估量
本参谋通过系统比较早期和晚期EGFR突变NSCLC的基因组特征,揭示了早期疾病中已存在的显赫基因组异质性。尽管共存基因变异的发生率相似,但早期患者具有较少的变异数目、较低的信号通路篡改频率和较低的EGFR突变丰采。这些特征共同组成了早期EGFR突变NSCLC先天耐药的基础基因组景不雅。
参谋成果强调,在早期EGFR突变NSCLC的调整决议中,应试虑进行全面的基因组分析,以识别可能从聚合调整计谋中获益的患者群体。跟着精确医学的束缚发展,基于个体肿瘤基因组特征的个性化调整计谋,有望进一步改善早期EGFR突变NSCLC患者的恒久预后,鼓动肺癌提拔调整向愈加精确、有用的标的发展。
参考文件:
[1]Wu Y-L, et al. Osimertinib in resected EGFRmutated non–small-cell lung cancer. N Engl J Med. 2020;383:1711–23.
[2]Seong H, et al. Genomic Insights into Innate Resistance in Early-Stage EGFR-Mutant Non-Small Cell Lung Cancer: A Comprehensive Analysis of Next-Generation Sequencing Data. Cancer Res Treat. 2025 Aug 25.
审批编号:CN-172503 有用期至:2026-02-21
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